現任董事長(第三、四屆)　任期 (2014年5月8日~2018年5月7日)

林逸民 醫師

　　1943年出生，1969年自中國醫藥大學醫學系畢業，1990年自日本北里大學醫學系博士班畢業。曾任美國眼科及外科學院院士。亦曾於諸多機構如:財團法人中華民國兒童燙傷基金會、財團法人中華民國安寧照顧基金會、中華醫藥促進基金會、財團法人宜蘭縣私立慕光盲人重建中心、中華民國心臟病兒童基金會擔任董事。自2008年起即擔任財團法人馬偕醫學院董事，並於2013年起擔任馬偕學校財團法人董事長迄今。現任羅東五福眼科院長。

　　商業周刊特別報導本校林逸民董事長在商業周刊《良醫健康網》三萬多筆的網友推薦中，以2,766個優良評價（截至2015.12.08止）拿下眼科冠軍，是良醫網中擁有最多五星級評價的醫生，本校深感與有榮焉。

第二屆董事長　任期 (2008年~2012年)

黃俊雄 醫師

　　黃俊雄(Chun-Hsiung Huang)教授1941年12月30日生於台灣台中，1968年於高雄醫學大學醫學系獲得醫學士學位，長年投身於馬偕紀念醫院醫療服務與管理工作，歷任馬偕紀念醫院醫務部部主任、副院長及院長等行政職務，對醫院成長與發展貢獻甚鉅。黃教授熱心社會公益，曾擔任台灣安寧照顧基金會、北海岸金山醫院和中華民國兒童燙傷基金會等機構董事長及中華民國骨科醫學會、中華民國關節鏡暨膝關節醫學會、醫學中心協會理事長等要職，扶助基層弱勢，落實馬偕精神，殊堪全體馬偕人表率。
黃教授專長於骨科醫療與關節重建，為國立陽明大學醫學工程研究所和台北醫學大學醫學系兼任教授及國立陽明大學骨科器材研發中心總顧問，學術研究成就卓越，立論精宏，斐聲國際，並以人工關節之相關研發成果獲獎無數，曾榮獲2008年國家新創獎、2009年行政院傑出科技貢獻獎，誠為馬偕之光。

　　黃教授於擔任本校第二任董事長期間，完成本校教育部登記立案，與陽明大學建立策略聯盟，完成第一期與第二期校舍新建工程，任內並為本校籌募捐款7,000多萬元，帶領學校行政團隊順利通過教育部校務評鑑，對本校校務之奠基與發展貢獻厥偉。

第一屆董事長　任期 (2005年~2008年)

林建德 醫師 (1945-2015)

　　1945年出生，曾任雙連教會長老、連任兩屆財團法人台灣基督長老教會馬偕紀念社會事業基金會董事長、財團法人中華民國安寧照顧基金會董事長、大同扶輪社社長、雙連教會視障基金會董事長等要職。服務社會，落實馬偕博士「醫療」、「傳道」、「教育」三大志業之精神，足為馬偕體系之楷模。

　　自2005年起即擔任財團法人馬偕醫學院第一屆董事長。對於籌設馬偕醫學院不遺餘力，四處奔走，盡心盡力籌措醫學院所需之校務經費，為醫學院奠立良好之根基。